OA研究技术路线图
2018-09-20 14:29:30 0 举报
骨关节炎研究技术路线图
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大纲/内容
确认候选miRNA及基因对OA的影响
差异基因进行GO功能富集
候选miRNA表达水平检测
对转基因OA小鼠，正常小鼠，非转基因OA小鼠中软骨组织情况进行检测，确认候选基因对OA的影响
动物实验及细胞实验等验证筛选获得的基因及miRNA在OA中的作用机制
构建候选基因敲除模型小鼠，并对转基因小鼠诱导OA
候选基因表达水平检测
在候选基因敲除小数中检测下游信号通路表达情况
对候选基因的潜在下游调控信号通路进行预测
在OA小鼠中构建信号通路敲除小鼠模型或抑制信号通路，检测OA情况
确认OA模型小鼠的表型
确认候选基因及候选miRNA在OA中的表达情况
对表达芯片中的基因进行GSEA分析
对小鼠中MMP-13，TNF等基因表达水平进行检测，并与其余两组转基因小鼠进行比较
公共数据库下载
构建候选miRNA敲除模型小鼠，并对转基因小鼠诱导OA
测序数据
对小鼠中软骨组织情况进行检测，并与其余两组转基因小鼠进行比较
对转基因OA小鼠，正常小鼠，非转基因OA小鼠中MMP-13，TNF等基因表达水平进行检测
动物实验及细胞实验等验证候选基因及miRNA的功能
starBase数据库预测调控miRNA
差异基因进行KEGG功能富集
对筛选获得的基因进行蛋白互作分析
对转基因OA小鼠，正常小鼠，非转基因OA小鼠中软骨组织情况进行检测，确认miRNA对OA的影响
基于生物信息学手段，确认OA中的核心基因及其调控miRNA，作为后续研究目标
对表达芯片数据进行差异分析
半月板手术构建骨关节炎小鼠模型
软骨组织染色
确认筛选获得的基因及调控miRNA对OA的作用机制
免疫荧光实验验证候选miRNA对候选基因的靶向调控
TargetScan数据库预测调控miRNA
生物信息学筛选OA相关基因及调控miRNA
多个数据库预测结果进行Venn分析，确认miRNA
miRDB数据库预测调控miRNA
目标基因的调控miRNA预测
构建候选基因及miRNA双高表达小鼠模型，并诱导OA
基于功能分析结果初步筛选候选基因
DIANA数据库预测调控miRNA
获得OA芯片表达数据
获得初筛基因中的核心基因，确认后续研究目标
滑膜组织染色
对转基因OA小鼠，正常小鼠，非转基因OA小鼠中MMP-13，TNF等基因以及候选基因的表达水平进行检测
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