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Pacbio lncRNA流程
2015-11-06 16:25:15
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Pacbio lncRNA鉴定流程
lncRNA
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大纲/内容
100个氨基酸过滤掉
PLEK构建模型
ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-85/fasta/sus_scrofa/
ORFs
pacbio isoform
≤100个氨基酸
BLASTN去掉之前发现的lncRNAs
BLASTX
前体序列
lncRNAs 和 microRN前体（ncRNA?）
猪蛋白序列(pre?)
基于模型
EMBOSS
预测候选lncRNA
novel lncRNAs
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Pacbio lncRNA流程
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职业：博士
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