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2021-11-24 15:11:08
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MATLAB
获得核小体占据位置得分和核小体结合亲和力分数
是否为最小值
FORTRAN(NuPoP)
清除扰动数据
得到总核小体结合亲和力值并选取累计亲和力下降最显著的启动子序列作为此轮优化的结果
清除扰动数据,阻止新转录因子阻碍位点生成,以及确保启动子为可作为gBlocks合成
识别转录因子阻碍位点
预测核小体结合亲和力
进行多轮优化,使用贪婪算法来获取多轮优化中的最小结合亲和力
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