探针杂交
预设探针+定制探针(不能单添加定制探针)
去掉一部分稀释buffer,与预设探针等体积添加即可
记录定制探针的ID 和相应slide NO.<br>
热盖50℃或是关掉热盖
杂交16-24 h
杂交后清洗<br>
取下卡夹,去掉盖子,去除杂交mix试剂<br>
如果有2个slide,先去除并添加试剂,再做第2个,避免slide干燥。<br>
立即加入500 ul PBS-T,室温孵育1min。去除PBS-T试剂
不要引入气泡
小气泡没有关系,不要吸或是戳破小气泡,容易导致脱片或是损失样本<br>
重复上一步 1次
加入500ul杂交后清洗buffer,盖盖并上PCR仪 37℃孵育30min
结束后立即进行下一步
连接
取下卡夹,去掉盖子,去除清洗buffer试剂
如果有2个slide,先去除并添加试剂,再做第2个,避免slide干燥。<br>
立即加入500 ul PBS-T,室温孵育1min。去除PBS-T试剂
重复上一步2次<br>
加入500ul 连接mix,盖盖并上PCR仪37℃孵育2h<br>
结束后立即进行下一步
扩增
取下卡夹,去掉盖子,去除连接mix试剂
如果有2个slide,先去除并添加试剂,再做第2个,避免slide干燥。<br>
立即加入500 ul PBS-T,室温孵育1min。去除PBS-T试剂
重复上一步2次<br>
加入500ul 扩增mix,盖盖并上PCR仪30℃孵育2h<br>
扩增后清洗
取下卡夹,去掉盖子,去除扩增mix试剂
加入500 ul TE,室温孵育1min。去除TE
重复上一步1次
加入500 ul TE
进行下一步或是保存
进行下一步<br>
安全停靠点:盖上盖子,4℃过夜或是不超过4天保存<br>
保存期间,不要开盖
自荧光淬火<br>
目的:减少由于醛固定、红细胞以及胶原蛋白/弹性蛋白结构造成的自发荧光
取下卡夹,去掉盖子,去除TE<br>
如果有2个slide,先去除并添加试剂,再做第2个,避免slide干燥。
加入1000ulPBS,室温孵育1min,去除PBS<br>
再重复上述步骤2次
500ul加入 稀释过的Reducing Agent B,盖盖,室温孵育10min。
取下卡夹,去掉盖子,去除Reducing Agent B<br>
加入1000ul 70%乙醇,等1min,弃掉。<br>
加入1000ul 100%乙醇,等1min,弃掉
重复上一步1次
立即加入500ul Autofluorescence Solution ,盖盖,<font color="#e74f4c">黑暗条件</font>下室温孵育10min<br>
去掉盖子,去除Autofluorescence Solution
加入1000ul 100%乙醇,等2min,弃掉<br>
再重复上一步2次
将卡夹放置于PCR仪上,进行37℃ 5min烘干,卡夹不盖盖子同时PCR仪不盖盖。<br>
不要干透
<font color="#e74f4c">立即</font>取下卡夹,并加入1000ul PBS重新水化组织,并<font color="#e74f4c">黑暗条件</font>下室温孵育1min。去除PBS<br>
加入1000ul PBS-T,<font color="#e74f4c">黑暗条件</font>下室温孵育2min<br>
可以进行拍照,以便对比组织形状判定是否有脱片<br>
保存或继续进行<br>
保存:安全停靠点,盖上盖子,4℃黑暗条件下保存不超过4天
保存期间,不要开盖
继续实验(推荐继续)
核染
去除PBS-T,加入500ul Xenium Nuclei Staining Buffer,<font color="#e74f4c">黑暗条件</font>下室温孵育<font color="#e74f4c">1min</font><br>
去除Nuclei Staining Buffer,加入1000ul PBS-T,<font color="#e74f4c">黑暗条件</font>下室温孵育1min
再重复上一步2次
加入1000ul PBS-T,保存或继续<br>
保存:安全停靠点,盖上盖子,4℃黑暗条件下保存不超过4天
保存期间不要开盖
继续进行实验<br>
什么核染染料?