跨职能流程图(垂直)
2016-12-17 16:15:15 0 举报
流程图练手
作者其他创作
大纲/内容
基因组注释(Augustus)
比较基因组学分析
印度、博兹瓦纳ST5型新生隐球菌菌株收集
我国除ST5型的其他ST型新生隐球菌临床株收集
群体结构的主成分分析(smartpca)
Illumina Hiseq 4000 第二代测序(深度200X)
我国ST5型新生隐球菌临床株收集
PE,MP基因组组装(ALLPATHS)
YPD平板培养24h后抽提全基因组DNA
基于SNP的群体基因组学分析
对ST5相比其他ST型独有的基因集进行功能注释及功能富集分析(GO,KEGG)
Haploview挑选tagSNP再进行Structure分析
150bp pair reads 短序列比对(BWA)
基于SNP的系统发育树构建(SNPhylo)
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