Share分析思路

2017-04-12 12:09:02   0  举报

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Share分析思路主要是通过对公司的财务报表进行深入研究，以了解公司的财务状况、盈利能力、偿债能力等关键指标。首先，我们需要收集公司的年报或季度报告，这些报告通常包含了公司的主要财务数据。然后，我们可以通过计算各种财务比率，如流动比率、债务资本比率、毛利率等，来评估公司的财务状况和运营效率。此外，我们还可以通过对比公司的历年财务数据，来了解公司的发展趋势和潜在风险。最后，我们还需要考虑公司的行业地位、竞争环境、宏观经济状况等因素，以全面评估公司的价值。通过这种方式，我们可以更好地理解公司的经营状况，为投资决策提供有力的支持。

作者其他创作

大纲/内容

200例control数据库随机抽取

HPA分析

ACMG

异常邮件通知

case 样本信息9例V6 公司测序65例线下 V6+不明（之前是V5）未提供性别信息control 样本要求Novo数据库随机抽取200例

Variants Calling(samtools)

WES

左侧矩形框内部分先不做先只做关联分析

2827 WES controls from Novogene in-house Novo-Zhonghua database

100 WGS controls from Novogene in-house dataset

QC(raw2cleanQC Novogene in-house software)

Mark Confidence Variants

Filter De novo Variants Hit in Controls

variation

共有基因排序

Filter Variants Hit in Controls

bam

质控

143 LVNC trios WES

WGS

邮件通知加测

Mapping(bwa)

22 LCA-(R)PA probands & 7 sporadics WES

位点关联

Model RecessiveConfidenceRepeat&SuperDupRemove ControlGnomAD_ALL < 0.0057

标注基因在患者中的共有情况

疾病：发作睡病发病率1-5/10000与脑、神经元相关

样本单call-C 50 参数

snp过滤条件： 1、Func：保留外显子去和剪切位点区（2bp）的变异位点 2、ExonicFunc：去除同义突变 3、频率：保留低频（1000gAll&NovoDB0.01 & GnomAD_All&GnomAD_EAS 0.001）的突变位点 4、过滤掉位于Repeat或者genomicSuperdup区的突变 5、有害性筛选：保留SIFT、Polyphen、MutationTaster、CADD中超过2个预测为有害的位点 indel过滤条件： 1、Func：保留外显子去和剪切位点区（2bp）的变异位点 2、ExonicFunc：去除nonframshift，stoploss 3、频率：保留低频（1000gAll&NovoDB0.01 & GnomAD_All&GnomAD_EAS 0.001）的突变位点 4、过滤掉位于Repeat或者genomicSuperdup区的突变 5、有害性筛选：保留SIFT、Polyphen、MutationTaster、CADD中超过2个预测为有害的位点

dup-自动去除dup，性别判断

De novo Calling(TriDenovo and Samtools Trio)

22 LCA-(R)PA probands & 7 sporadics WGS

Union Set of De novo Variants with Two Softwares

v4.6注释过库筛选

2个以上共有基因

Filter MAF in GnomAD ALL < 0.0057

mapping

Novo基因频率注释

bed区间：V6-V5外显子捕获试剂盒的交集

Gene Burden分析

Filter Repeat & SuperDup Variants