version4.4
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作者其他创作
大纲/内容
defwrite_job
判断name是否在title中
如果以#开始，继续
defgetped
defgetsex
title转化为小写字母
判断参数传递
string
FinFo
defgetpos2
不存在，sched为sched
如果name在title中，pos为name的位置
否则datainfo为1
文件不存在，抛出异常
tsched是否存在
没有samnamename为shellnamestatus为waitingcmd为shellname.sh
没有th，默认为6
传入参数string
468-538行
存在，获取文件绝对路径
tmpline[]为转化为小写的每列信息
如果name2不等于空，提示name和name2不在title中
如果samp_info为空，analy_array5，退出并提示模式筛选需要提供家系信息
如果name2不为空且在title中，pos为name2的位置
如果th/samname都存在
获得patient和normal列表如果p/n且datainfo!=0添加sampleid到相应列表
defsafe_open
文件是否以.fq为结尾
是，引入gzip模块，解压读取文件
是否存在samp_info
如果name2等于空，提示name不在title中
如果#disease存在，存入DisInfo/如果#gene存在，存入GeneInfo
【５０３行】如果连锁分析，datainfo没有index值的话，datainfo赋值为1
name为shellname_samnamecmd为shellname_samname.sh
defgetnp
职业：工程师
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