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2020-10-26 20:22:59 0 举报流程思路
作者其他创作
大纲/内容
对11只F2小鼠，36只F4小鼠和72只F5小鼠进行了测序。Illumina Hiseq2500或Hiseq4000平台
研究梗概
绘制高分辨率的CO和NCO的map
材料：跨越5个世代的两个小鼠品种
NCO和CO事件都发生在单个重组热点中，其概率与使用DMC1或H3K4me3富集估计的热量近似成比例
收集雄性(B6xCAST)F1-Prdm9 (Hum / Cast)小鼠睾丸的DMC1和H3K4me3的ChIP-seq数据。
应用基于隐马尔可夫模型的算法来推断小鼠基因组中每个SNP的背景状态
方法
NCO和CO事件以及DMC1和H3K4me3都显示出更接近端粒的富集，尤其是雄性CO。
11个F2动物的常染色体上鉴定出183个NCO和295个CO事件
整体事件属性
研究结果
材料与方法
与人类女性中发生的NCO事件相比，观察到的NCO事件中有99.5%是简单的，由连续的转换snp区域组成，其中没有非转换snp。
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