分子路标(染色体标记)<br>
位点
位点是指基因组物理图上某一确定的DNA顺序<br>
最早发现的分析路标RFLD<br>
1) 处于染色体上的位置相对固定;<br>
2) 同一亲本及其子代相同位点上的多态性片段特征不变;
3)同一凝胶电泳可显示等位区段不同多态性片段,表现为共显性。<br>
4)需要用Southern杂交检测显示。
第二代分子标记SSR<br>
1)在基因组中分布均匀;<br>2) 可用DNA测序凝胶直接显示,检测方便;<br>3)杂合子DNA多态性表现共显性;<br>4)群体中SSR标记的多态性信息量高。<br>
SNP标记
1) DNA单链的每个碱基位置可有4种选择:A,T,C, G ,即4种可能的多态性。因此SNP可由核苷酸代换产生;<br>2) 人类基因组平均600bp含一个SNP,密度高,分布均一;<br>3) 人类基因组SNP总量大于500万;<br>4)紧密连锁的SNP可组成单倍型(Haplotype),便于构建进化树;<br>5) SNP的缺点︰需要DNA测序或芯片杂交确定,费用较高。<br>
群体多态性组成频率(PIC)<br>
多态性信息量(polymorphic information content,PIC)PIC用来表示群体中某一位点多态性的程度:<br>
大肠杆菌遗传作图<br>
大肠杆菌的遗传图绘制主要采取结合转移方法。<br>通过转移供体染色体片段与受体细菌同源DNA发生重组与交换,可绘制遗传遗传图。<br>遗传图图距以转移时间计算,图距单位为分钟。<br>