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基因组学绪论+第一章

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基因组学绪论+第一章

2021-03-01 21:08:36   13  举报

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基因组学杨金水教授的课程笔记

基因组学

杨金水

生物信息学

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大纲/内容

基因组学-基因组计划缘起

首次提出：科学家想快速准确测出日本受原子弹影响人群的基因组<br>

推波助澜：1986年，杜贝提出基因测序两条路<br>

DNA测序

基因组作图<br>

成功里程碑

2001年人类基因组工作草图的发表

基因组学重要进展

基因组测序与注释

人类基因组DNA成分百科全书计划<br>

非编码RNA<br>

单细胞测序

基因组表观遗传<br>

DNA双螺旋结构的发现<br>

孟德尔提出所谓的”遗传因子理论“<br>

沃森和克里克使用富兰克林的图谱进行创造，提出双螺旋结构

基因组-DNA-RNA-蛋白质<br>

基因组学概念：概括涉及基因组作图、测序、和整个基因组功能分析的遗传学学科分支<br>

DNA结构特点

DNA由两条具有极性的互补单链组成<br>

两条互补单链走向相反

DNA双螺旋大小沟槽交替排列

碱基配对原则:A-T，C-G，A-T配对形成2对氢键，C-G配对形成3对氢键。

每旋转一圈为10.5 bp(碱基对)

RNA的结构与生物学

生物体内几乎所有的RNA分子均为单链。

RNA分子中对应于DNA中胸腺密啶(T)的碱基由尿啶(U)取代。

RNA分子也可形成双链RNA，即可分子间配对，也可分子内配内。<br>配对原则与DNA碱基配对类似,只是DNA中的A-T配对在RNA中为A-U配对。<br>RNA分子内配对可形成茎环(或发夹)结构。

RNA分子易于断裂，长度有限。

生物体内几乎没有任何双链环化RNA分子。

蛋白质

模体是功能蛋白质的结构部件。<br>

许多保守的转录因子蛋白含有锌指结构(zinc finger)，是十分常见的蛋白质基序。

锌指基序含3个二级结构:

α-螺旋，β-折叠和转环<br>

蛋白质的三级结构中结构和功能上相对独立的区域，称为域(domain)。<br>

基因组结构特征<br>

C值悖理

生物体的单倍体基因组所含DNA总量称为C值。<br>

生物基因组的大小同生物的复杂性及其在进化上所处的地位无关

基因组DNA的顺序组成

单一顺序

中度顺序<br>

高度重复序列<br>

基因与基因家族

基因

经典遗传学:决定表型的独立的遗传单位，可在上下代之间传递。

分子遗传学:由一段可转录的区域和调控区域组成的DNA序列，表达单位。

基因家族<br>

同一物种或不同物种中来自一个共同的祖先，因加倍趋异而产生的一组具有相似顺序组成的基因成员。<br>

具有氨基酸顺序相似性<br>

具有相同的功能域

假基因<br>

来源于功能基因但已失去原有活性的DNA顺序<br>

重复假基因

加工假基因

残缺假基因

单一假基因<br>

真核基因组与原核基因组

差别

<br>

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第一章物质世界及其发展规律

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基因组学第二三章

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第一章

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第一章绪论

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