重农抑商政策
商鞅奖励耕织的政策固然没错，但他又规定凡从事末业（工商）者，全家没入官府，罚为官奴婢。
这种重农抑商政策政策以后被历代封建统治者奉为金科玉律，即时在封建社会早期已无多少积极作用，到我国封建社会后期更是成为严重阻碍工商业发展的政策。
“编民为什伍”和“连坐”法
商鞅为了加强管理和统治广大居民，规定分五家为一伍，两伍为什。又规定什、伍之内各家互相纠察，“不告奸者腰斩，告奸者与斩敌首同赏，匿奸者与降敌同罚。”
这种使人民互相监视、互相告发，从而使全体人民时刻处在互相猜疑的白色恐怖之中，到王安石变法时演变为“保甲制度”，以后又被国民党所继承。到抗日战争时期，沦陷区的日本侵略者也实行保甲制度。
轻视教化，鼓吹轻罪重罚
在一定程度上加重了广大人民所受的剥削与压迫，在一定程度上给广大人民带来巨大的痛苦。
