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2024-04-10 17:39:54 4 举报
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作者其他创作
大纲/内容
具体发药的值及单位应该从protocol里找,并且和项目组确认。
1.根据结构问题 DA,rawdata数据中没有发药的值,DATESTCD
REQ变量为必须变量,EXP为期望变量,需要仔细阅读SDTMIG
Spec设置输入约束
MetaGen增加检查
CM CRF中搜集了同AE,MH之间的关联,但未作RELRECCM;
EX中搜集了同AE之间的关联,但未做RELRECEX
3.Rawdata中搜集了不同的domain之间的关联,却未作RELREC数据集
确定要做RELREC:观察CRF,RELREC应做尽做
明白如何做:培训如何填写Spec及如何编程
总结
某些domain中,other_中specify的信息未放到SUPP中
4.具体说明信息或者不能放到标准变量里的信息,未放到SUPP domain里
所有的信息都得放到SDTM Domain中
提升对CRF/aCRF的理解
IE数据集应与TI相对应
5.Key变量对应重复记录 IE中EXCL02有重复记录,实际应属于EXCL02下的两个不同子分类
Label长度应小于40,变量名长度小于8 报warning
Label名字应有意义,不能直接从CRF中抄
6.SUPP中label截断,SUPPDM中label截断
DS未考虑study disposition 及study drug disposition
DSDECOD中英文混合,并且未map到标准的编码
7.结果不标准 (项目共性问题,后续不重复记录)
项目开始前就要和申办方确认语言,如果是全球申报的,从一开始就建议申办方用英文,翻译成中文会方便一些;如果只递交CDE,从一开始就用中文
中文项目不要中英文混用,CT不完整时可以参考之前的项目
康乃德 C_069_DER_CBP_201_CN0002
需要仔细核对修改。
8.Controlled Terms or Format 列列出来的Code跟Controlled Terminology页并不是一一对应的。
Programming Note要统一,follow一样的标准
9.Programming Notes列都是英文
CT不要remove,要保持完整性
10.IDVAR有的有CT,有的没有CT
统一修改,统一写法
11.Raw data的变量书写格式不一致,有的在AE中是大写,在DS中是小写Domain的CT根据CDISC的建议,应该填写为具体的DM,AE等,而不是直接写DOMAIN
在spec中加入AEYN='是'的筛选条件
Event Domain只需要收集实际发生的记录,Finding Domain则按需保留
12.不是所有来自raw data AE里面的数据都需要做进SDTM中
13.raw data AE.AEACN2O没有做到AE中去
版本信息保留在SUPP Domain,编码的term放在主domain中
智康弘义 C_285_ONC_BC3402_001_M826
变量要follow CT
15.DM Country follow ISO 3166 code for China is \"CHN\"
Perm variable都为空时可以去除
16.Drop all null Perm variable
变量不止从数据集里获得,还要根据study来获得
17.ECDOSFRM set to 'INJECTION'
Code list follow SDTM IG
18.PETESTCD please creaet codelist for PETESTCD
维昇药业 C_119_END_TCP_306
AESPID 通常可以在CRF获得(AENUM)
AEGRPID算法,可以参考:
注意变量加入的dummy值
20.数据里面有DSTERM = \"<ORI_DUMMY>\"
Exp变量需要保留
21.保留2个期望变量EXDOSFRM和EXENDTC, EXDOSFRM直接赋值为“注射剂”。EXENDTC 赋值等于EXSTDTC
鸿运华宁 C_157_END_GMA102_III_01
202207 既往问题总结– < Zheng Peng > <15:40-17:20>
202210 SDTM质量反馈– < Homin Zhao > <14:10-14:50>
1.PK exposure需要注意“PK EXPOSURE”和PC中结果的时间节点的对应关系,
2.Trail designTE需要按照时间顺序进行排序
3.IE注意:需要留意最新版本方案中IE是否改动更新
4.Assessment中的clinical significant注意:不同版本中的mapping的区别建议:IG 3.2建议有无临床意义做个QNAM放到SUPPQUAL
5.关于MI的mapping建议:CD3/CD4/CD8可以参考最新的CT的Microscopic Findings Test Name建议这3个test所在的CRF form map到MI。
202302 关于项目中遇到问题的讨论 – < Homin Zhao > <15:41-16:30> 约50分钟
建议:结合IG 3.2上的说明(Appendix C1: Trial Summary Codes),例子和standard CT来了解。
1.TS domain中的参数COMPTRT/CURTRT
2.ETHNICC在IG 3.4的说明
注意:对于not dose的记录,在EC用ECOCCUR=N来标识。不用按照ECMOOD拆2条,直接ECMOOD空着就行。ECMOOD是permissible 变量,可以有空值。 注意:对于Dosed的记录,ECOCCUR可以按照IG这个说明来 对于scheduled,ECOCCUR赋值NA,对于performed,按照实际情况赋值。ECOCCUR赋值空P21会报warning,可以赋值NA。注意:能否为空是由Core决定,而不是CT
3.对于not dose 在EC/EX中的mapping
202303 关于项目中遇到问题的讨论 – < Homin Zhao > 录屏1h15分
PD(Pharmacodynamic)数据的mapping (C_341_HEA_CG_US_0255_01)
HCV的mapping
有预知情的Inform consent的mapping (C_315_ONC_CBP_1008_201)。
Biomark (生物标志物)的map。
202305 以项目为例相关的分享-< Homin>
目前需要大家,跑完Spec检查一下,如SDS有问题需另存一份。后面会把SDS词典内容整合到下载的aCRF mapping file。
1.DM提供的SDS文件打开可能会发生错误,SAS无法读取,会导致生成Spec的时候CT页缺失内容
我们这里会看情况,SE中开始时间缺失会填xxT00:00 结束时间填 xxT23:59防止 se中 1月1日-1月2日 dtc中 1月2日9:00 被排除
直接用字符型的dtc变量比较判断的epoch,没有填补
2.EPOCH的SAS程序判断(%SG_EPOCH)
Q1:是否需要VISIT这个CT 或按照Domain出VISIT?来自客户Comments (C285 所有visit /C217 SV.VISIT )
Q2:是否统一做法:在DBL之前,CT中仅列出计划访视,在Define阶段,由PL读取数据集中所有非计划访视加入CT中A:这属于客户额外的要求。如果客户需要,可以更新,并和客户说明一下。在Spec模板中不做统一要求。
3.VISIT变量的CT在define中的处理
需要注意这并不是一种普适性的做法,通常我们尽量不要在SDTM中删除rawdata的信息。
4.SV的做法:Ref中删掉了知情同意之前的日期
202306 问题讨论-< Yi Lu> -录屏第10分钟
202308 C_135_ONC_LBL_007_CN_003项目 SDTM问题汇总- Xiaoxia He录屏第52分钟
202311 Local项目Lab模块常见问题分享– Mengjiao Li 录屏第14分钟
202312 D1553 项目客户反馈分享– Jingjing Li 录屏第61分钟
项目相关
XXENRTPT和 XXENTPT 需要参考CCI获取它收集信息的时间点
202303 简单分享TR/TU domain-< Zheng Peng> 录屏5分
SDTM 域的导图链接:https://www.processon.com/view/link/644b24f128fead03fe42baa2
SDTMIG v3.2 导图链接:https://www.processon.com/view/link/644a1bf02ec532330b0284c0
202304 SDTM&SDTMIG导读-< Yaozong Guan>
202306 Define Review Summary -< Jinjin Wang> -录屏第30分钟
202307 FA domain 定义介绍以及常见举例- Yuhang Chen录屏第1分钟
1.关于新鲜肿瘤活检(Fresh Tumor Biopsy)的SDTM mapping。
2.关于AJCC TNM的mapping。
3.关于Cancer History的mapping。
4.关于Diary的mapping。
202307 Mapping相关的分享-Homin Zhao -录屏第12分钟
202309 Re-screened Subjects in SDTM – Binjie Zhu 录屏第7分钟
202309 关于日期变量命名的问题说明– Zheng Peng录屏第54分钟
202310 SE的思路分享– Yanjie Chen 录屏第1分钟
202312 MB/MS相关的经验分享–Ling Zhou录屏第46分钟
202401 PC/PP domain介绍–Linfeng Chen录屏第12分钟
202402 IG3.3,3.4项目经验分享– Lijuan Zhao录屏第6分钟
CDISC, IG 相关
会议录屏地址:\\\\mst13\\MST_DIS010_CRT Package\\DIS_003_Related Training and Learning\\Define Generator InstructionCSA_Define_Generator说明地址:\\\\mst13\\MST_DIS010_CRT Package\\DIS_007_Implement Coding\\Define-XML\\CSA_Define_GeneratorSpec地址:\\\\mst13\\MST_DIS010_CRT Package\\DIS_007_Implement Coding\\Define-XML\\Spec
202209 介绍新的Define Generator – < Jinjin Wang > <15:00-16:30>
https://macrostat365-my.sharepoint.com/personal/yi_lu_tigermedgrp_com/_layouts/15/Doc.aspx?sourcedoc={94ab5ef9-aaef-423b-8886-53a511b6eb14}&action=edit&wd=target%28%E8%87%AA%E7%94%B1%E5%8F%91%E6%8C%A5.one%7C4cd72c41-3c2e-48bf-aab1-c7083cccd127%2FSDTM%20Spec%E7%9A%84%E5%88%86%E4%BA%AB%7C2062277e-dcab-4d20-a5b5-91b8eca8b093%2F%29&wdorigin=NavigationUrl
202210 关于SDTM Spec的分享及讨论– <Yi Lu> <14:50—16:30 >
\\\\pdrive.macrostat.com\\Biometrics\\MST_SDTM\\Training\\Library\\aCRF
202301 关于aCRF的分享 – < Homin Zhao > <14:31-15:40>录屏第17分开始
202301 如何处理Spec CT页– <Yi Lu> <15:41—16:00 >录屏第1小时30分开始
202308 SV DM的更新/编码的介绍&如何选择编码– Yaozong Guan录屏第1-32分钟
202309 aCRF工具II期更新的需求 – Yi Lu录屏第35分钟
1.P21 rule检查内置metadata的查看
a.RELREC的标注方法(关于等于号)
b.Variable value的虚线框(当前工具未更新)
2.DIS aCRF当前工具注释说明:
202310 P21 rule检查内置metadata的查看/ DIS aCRF当前工具注释说明– Yi Lu录屏第 10分钟
http://10.0.55.150:3838/mst/saworkplace/
202310 收藏工作路径的工具分享– Yaozong Guan录屏第31分钟
202312 subCO程序实现演示– Yi Lu录屏第81分钟
202401 谋思团队与Safety团队合并工作的讨论–Linfeng Chen录屏第37分钟
DIS等工具
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